Bundan uzun yıllar önce "Işık Devi" olarak bilinen dünya dışı bir canlı, Özel Bilimsel Araştırma Birliği'nde çalışan Shin Hayata ile bedenini birleştirmiştir. İkisinin birleşmesiyle oluşan Ultraman, dünyayı Kaiju adı verilen korkunç canavarların istilasına karşı savunmuştur. Bu olayın üstünden yıllar geçtiktikten sonra, günümüzde dünya gezegeni barış içindedir ve o kara günlerin hatıraları hafızalardan silinmeye başlamıştır. Ancak gölgelerin ardında yeni bir kötülük vücut bulmaktadır. Bu tehditle başa çıkabilecek tek kişi ise yeni bir tür kahraman, yeni bir tür Ultraman'dir. Shinjiro, efsanevi kahraman Shin Hayata'nın oğlu olmasını hariç tutarsak son derece sıradan bir gençtir. Babasının "Ultraman Factor"ü ona devrettiğini ve inanılmaz bir güce sahip olduğunu öğrendiğindeyse hiçbir şey eskisi gibi olmayacaktır.